LabDAO brengt de toekomst in kaart van open-source AI voor het ontdekken van geneesmiddelen

Het Folding@home-project haalde de krantenkoppen tijdens de COVID-19-pandemie voor het verzamelen van ongebruikte rekenkracht om de zoekruimte voor het vouwen van eiwitten te verkennen om het nieuwe coronavirus aan te pakken. Door burgers in staat te stellen zelf wetenschappers te worden, voerde het initiatief grootschalige simulaties uit van verschillende moleculaire configuraties van eiwitten over een gedistribueerd netwerk van "ingeschreven" computers over de hele wereld.

Dit gedecentraliseerde paradigma werd aangekondigd om mensen samen te brengen rond een gemeenschappelijk probleem en om rekenkracht efficiënt te crowdsourcen, maar wat als de rekenkracht en de probleemoplossende infrastructuur omgekeerd waren? Met andere woorden, wat als individuen hun eigen projecten zouden kunnen uitvoeren door gebruik te maken van de verzamelde rekenkracht en de tools voor biologische experimenten om op te starten?

LabDAO maakt die droom werkelijkheid met zijn PLEX-platform. PLEX is een open-source opdrachtregelprogramma dat is ontworpen om niet alleen computerbronnen, maar ook een verscheidenheid aan biologische machine-leertools (de "BioML" -suite binnen LabDAO) toegankelijk te maken voor verschillende achtergronden. Of het nu gaat om het experimenteren met docking van kleine moleculen of het zelf vouwen van eiwitten, met PLEX kunnen gebruikers gebruikmaken van LabDAO's bibliotheek met tools, resultaten delen en visualiseren in minder dan vijf minuten.

Deze reeks tools en het platform dat het gebruik mogelijk maakt, werd begin april tentoongesteld op Zuzalu's Blockchain Meets Biology-top, waar LabDAO Core Team-lid Lily Hansen-Gillis van begin tot eind een simulatie demonstreerde van de interne moleculaire dynamiek van een eiwit om de meest stabiele configuratie te vinden. Vervolgens leidde ze, als een zelfverklaarde 'niet-codeerder', het publiek er van begin tot eind doorheen - allemaal met een computer, wifi, PLEX op de opdrachtregel en niets meer.

Meer in het algemeen is LabDAO een gedecentraliseerd web3-platform (onderdeel van de grotere "DeSci"-beweging) dat zich inzet voor het creëren van een productievere omgeving voor het ontdekken van geneesmiddelen op basis van open source. Door geavanceerde tools en bronnen beschikbaar te maken voor een breder ecosysteem, wil LabDAO de juiste omgeving creëren voor transparante en toegankelijke wetenschappelijke vooruitgang. Of het nu gaat om het elimineren van de noodzaak voor onderzoekers om hun eigen hardware of computerinfrastructuur te hebben, of om de resultaten van experimenten op een blockchain-grootboek te publiceren, zodat ze traceerbaar en reproduceerbaar zijn, de organisatie zet zich in om meer innovatie mogelijk te maken door samenwerking - door barrières te slechten die worden veroorzaakt door slechte bruikbaarheid en siloed, niche-expertise.

LabDAO's inspanningen om deze DeSci-wereld van de toekomst voor vandaag te bouwen, kregen onlangs een boost in de vorm van een financieringsronde van $ 3.6 miljoen van verschillende andere DAO's, Inflection.xyz, Balaji Srinivasan en anderen. Deze instroom van ondersteuning zal bijdragen aan de voortdurende inspanningen om open-source softwaretools uit te bouwen en het onderzoeksecosysteem van LabDAO te versterken.

Wat betreft PLEX zelf, de onmiddellijke volgende stappen aan de horizon zijn het testen van het platform in verschillende wetenschappelijke samenwerkingen, het in containers plaatsen van verschillende tools en het verzamelen van de benodigde hardware om het BioML-netwerk te ondersteunen.

Wat de lange termijn betreft, zal misschien het volgende levensreddende medicijn tijdens de volgende grote uitbraak van infectieziekten worden ontworpen met de kracht van PLEX, één gedecentraliseerde stap voorwaarts. Naarmate het ecosysteem blijft groeien, zal alleen de tijd het leren.

Bedankt aan Aishani Aatresh voor aanvullend onderzoek en rapportage over dit artikel. Ik ben de oprichter van SynBioBeta, en sommige van de bedrijven waarover ik schrijf zijn sponsors van de SynBioBeta-conferentie. Voor meer inhoud kunt u zich abonneren op mijn wekelijkse nieuwsbrief.